Cap cirurgia no està exempta de complicacions, encara que les tècniques d'otoplàstia són molt segures i fa molt de temps que es practiquen.
A les primeres hores hi ha risc d'acumular sang als teixits de la cirurgia, que és el que tècnicament s'anomena otohematoma, i de vegades cal fer una punció per a evacuar-lo.
Els primers dies hi ha risc d'infecció. La infecció és la complicació més greu de l'otoplàstia, per això és molt important prendre l'antibiòtic corresponent i fer bé les cures.
A llarg termini hi ha una complicació que és pròpia de l'otoplàstia, la recidiva. L'esquelet de l'orella està format per cartílag. El cartílag és un material que es diu que té memòria, això vol dir que té tendència a tornar a la seva forma anterior, per això hi ha risc durant els primers mesos que l'orella, a poc a poc, torni a la seva forma original. El risc de recidiva és baix, però no podem dir que sigui zero. Si la recidiva es dóna la seva solució no és massa complicada, però s'ha de tornar a repetir la intervenció.